A 14. körre aztán egyre fenyegetőbbekké váltak a meteorológiai viszonyok, ezért Raikkönennek esőgumit raktak fel, amivel a finn körönként húsz másodpercet veszített a többiekhez képest.
Ekkor még elhamarkodott lépés volt lemondani a slickekről, a 21. körben aztán megjött az égi áldás. Ekkor mindenki esőgumit rakott fel, kivéve Glockot, aki az intermediate mellett tette le voksát, amivel nyolc kör alatt az élre állt. A 30. körre ismét bekeményített az eső, a versenyzők egymás után hagyták el a pályát, hol a boxutcsa, hol a kavicságy volt a végállomás. A káoszt érzékelteti, hogy Button három körön belül kétszer volt kereket cserélni, mégis az élre jött vissza.
És a brit ott is maradt egy kör erejéig, amikor is előbb bejött a safety car, majd egy újabb körrel később felfüggesztették a versenyt.
A versenyzők a rajtvonal mögött sorakoztak fel és ott álltak egy órán keresztül. Volt akinek az autóját egyenesen a boxba vitték (Raikkönen), volt aki falatozott közben (Massa) és volt aki ki sem szállt a járműjéből (Hamilton.) Közben Alonso a BBC-nek azt nyilatkozta, reméli, nem indítják újra a versenyt, mert a pálya egyes részein akkora a víz, hogy még a biztonsági autó sem képes átmenni rajta és nem ritkák az átfolyások sem, míg Webber azért lobbizott, mert egyre sötétebb lett Sepangban.
Végül nem indították újra a futamot, így Button második idei versenyét is megnyerte. A végére is maradt némi izgalom, ugyanis nem az a Glock lett második, aki másodikként ért a rajtvonalhoz, hanem Heidfeld, aki az utolsó teljes kör végén még az ezüstös helyet birtokolta.
Mivel azonban a versenyzők a futam kevesebb, mint a 75%-át teljesítették, így a pontokat megfelezték, amire az 1991-es Ausztrál Nagydíj óta nem volt példa.
Malajziai Nagydíj:
1. Jenson Button (brit, Brawn GP) 1:10:59.092 ó (átlag: 145,241 km/ó)
2. Nick Heidfeld (német, BMW-Sauber) 22.700 mp hátrány
3. Timo Glock (német, Toyota) 23.500 mp h.
4. Jarno Trulli (olasz, Toyota) 46.100 mp h.
5. Rubens Barrichello (brazil, Brawn GP) 47.300
6. Mark Webber (ausztrál, Red Bull) 52.300 mp h.
7. Lewis Hamilton (brit, McLaren-Mercedes) 1:00.700 p h.
8. Nico Rosberg (német, Williams) 1:11.500 p h.
9. Felipe Massa (brazil, Ferrari) 1:16.900 p h.
10. Sébastien Bourdais (francia, Toro Rosso) 1 kör h.
11. Fernando Alonso (spanyol, Renault) 1 kör h.
12. Nakadzsima Kazuki (japán, Williams) 1 kör h.
13. Nelson Piquet Jr. (brazil, Renault) 1 kör h.
14. Kimi Ra:ikkönen (finn, Ferrari) 1 kör h.
15. Sebastian Vettel (német, Red Bull) 1 kör h.
16. Sébastien Buemi (svájci, Toro Rosso) 1 kör h.
17. Adrian Sutil (német, Force India) 1 kör h.
18. Giancarlo Fisichella (olasz, Force India) 2 kör h.
Leggyorsabb kör: Jenson Button, 1:36.641 p
Pontverseny:
1. Jenson Button 15 pont
2. Rubens Barrichello 10
3. Jarno Trulli 8,5
4. Timo Glock 8
5. Nick Heidfeld 4
6. Fernando Alonso 4
7. Nico Rosberg 3,5
8. Sébastien Buemi 2
9. Mark Webber 1,5
10. Lewis Hamilton 1
11. Sébastien Bourdais 1
csapatok:
1. Brawn GP 25
2. Toyota 16,5
3. BMW-Sauber 4
4. Renault 4
5. Williams 3,5
6. Toro Rosso 3
7. Red Bull 1,5
8. McLaren-Mercedes 1
Következik: Kínai Nagydíj (április 19., Sanghaj)
